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通常来看，城市生态学的命题本身具有矛盾性，因为城市本身不是天然的生态系统而是人工创造物，城市，如同其他人工产品例如工业品和文化出版产品一样，是非天然的，非生态的。
如何能够把一个非生态系统的产物作为生态系统来研究呢。
这里涉及一个基本哲学问题：人本身和人的一切创造是否是生态系统的一个部分。
即人和人造物（包括城市）是否是自然意志的一部分。
如果是，那么人的命运本身就是生态循环的一个环节，人的一切行为就是自然生态的结果而不是原因，人不可能通过干涉生态体系的变化改变自己的命运，这好比自己的嘴不可能吃掉自己。
亦或人的意志是相对于自然生态独立的存在，人和人的创造并非自然生态体系的部分。
如果是，那么企图用自然生态的方法研究城市系统就是错误的。
所谓城市，在形态上是物质，能量的高度密集（相对自然生态环境可以叫变态密集），在过程上是生产，消费，排泄的快速集中（相对自然循环可以叫变态循环）。
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补充：
对人为因素导致全球变暖的质疑越来越多，很多科学家坚持全球暖化是自然演变，不是人为结果
猜想: 城市不是从来就有的，城市这种形态也是一个历史阶段，有产生，发展，消亡的过程
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